2000 yılında Çin ve ABD arasında her alanı kapsayan üst düzey temaslar ve işbirliği arttı. Aynı yılın 15 Aralık günü Amerikan Kongresi'nde kabul edilen “Kapsamlı Tahsisat Yasası” ile, ABD'nin Çin'in Yugoslavya'daki büyükelçiliğine düzenlediği saldırının yol açtığı zarar için 28 milyon ABD doları ayrıldı.
1 Nisan 2001'de ABD'ye ait EP-3 tıpı askeri keşif uçağının Çin'in Hainan adasının 104 kilometre güneydoğusundaki karasuları üzerinde keşif yaparken, kendisini takip eden Çin'e ait F-8 uçağına çarpması sonucu, Çinli pilot Wang Wei öldü. Amerikan uçağı olaydan sonra izin almadan Çin hava sahasına girdi ve Hainan adasındaki Lingshui askeri hava alanına iniş yaptı. Çin Dışişleri Bakanı Tang Jiaxuan 11 Nisan'da, Amerikan yönetiminin tam yetkili temsilcisi ve ABD'nin Çin'deki büyükelçisi Joseph Prueher'in olayla ilgili olarak Amerikan yönetimi adına sunduğu özür mektubunu aldı.
ABD'nin uğradığı 11 Eylül saldırıları önemli can ve mal kaybına yol açtı. 19 Ekim 2001'de, Çin Cumhurbaşkanı Jiang Zemin Çin'in sanayi kenti Shanghai'de ABD Başkanı George W. Bush ile görüştü. İki lider görüşmede, iki ülke arasındaki ilişkiler ve terörle mücadele gibi önemli konular üzerinde fikir alışverişinde bulundular ve geniş fikir birliğine vardılar. İki taraf aralarındaki yapıcı işbirliği ilişkilerini var güçle geliştirmek için çaba harcamayı kabul ettiler.
2002'de, Çin-ABD ilişkilerinde bazı rahatsızlıklar yaşanmasına rağmen genel olarak iyileşme ve gelişme eğilimi korundu. Başkan Bush, Jiang Zemin'in davetlisi olarak 21-22 Şubat günlerinde Çin'e çalışma ziyareti yaptı. Tekrar bir araya gelen iki lider görüşmede ikili ilişkiler ve mevcut uluslararası durumu derinliğine ele alarak, iki ülke arasındaki diyalog ve işbirliğinin güçlendirilmesi, aralarındaki fikir ayrılıklarının uygun şekilde çözülmesi, yapıcı işbirliği ilişkilerinin daha da gelişmesi için ortak çaba harcanması gibi konular üzerinde anlaştılar. Jiang Zemin, Başkan Bush'un daveti üzerine Ekim ayında Meksika'da düzenlenen Asya-Pasifik Ekonomik İşbirliği Toplantısı'nın öncesinde ABD'yi ziyaret etti. Jiang Zemin, Bush'a Taiwan sorununun uygun şekilde çözülmesinin Çin ve ABD arasındaki ilişkiler için taşıdığı önemi vurguladı. Bush, ABD'nin “Tek Çin” politikasında ısrar etmesi ve iki ülke arasında imzalanan 3 ortak bildiriye uymasının ve Amerikan yönetiminin her zaman izlediği politika olduğunu ve bu politikanın değişmediğini yineledi.